AMALIAN Jean-Arthur

AMALIAN Jean-Arthur (alumni)

Post-doctorant

Equipe Spectrométries Appliquées à la Caractérisation Structurale (SACS)

Activités principales

Mon axe principal de recherche s’inscrit dans le domaine de la spectrométrie de masse des polymères synthétiques. Plus particulièrement, j’ai été impliqué ces dernières années dans le développement de méthodologies analytiques pour la lecture d’informations codées à l’échelle moléculaire dans des polymères synthétiques à séquence contrôlée. Ces polymères digitaux sont constitués de chaînes monodisperses dans lesquelles la séquence contrôlée des co-monomères, définis comme les 0-bit et 1-bit de l’alphabet ASCII, est utilisée pour stocker des messages à l’échelle moléculaire.

Lire de tels messages est typiquement un exercice de séquençage qui est réalisé par spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) à condition d’atteindre une couverture de séquence totale. Pour remplir cette condition, la dissociation des chaînes doit se produire par rupture de liaisons du squelette polymérique mais ne pas générer trop de fragments pour éviter une dilution du signal et garder une certaine facilité de lecture du message. Parce que le comportement dissociatif d’un polymère est dicté par la nature de ses liaisons chimiques, mes travaux de recherche ont permis de proposer une stratégie appelée « design assisté par MS/MS » où les données MS/MS sont utilisées pour optimiser la structure de longs polymères afin d’améliorer leur lisibilité. Cette stratégie repose notamment sur la compréhension des mécanismes de fragmentation des polymères afin de proposer des optimisations structurales visant à créer ou rendre silencieuses certaines fragmentations en MS/MS.